La funzionalità del Dipartimento si basa sui seguenti organi:

Il Direttore (art.31 Statuto): Prof. Marco Oriani (quadrienni accademici 2012/13 - 2015/16, 2016/17 - 2019/20,  2020/21 – 2023/24)
Il Direttore del Dipartimento è eletto dal rispettivo Consiglio tra i professori di prima fascia, secondo le modalità stabilite dal Regolamento Generale di Ateneo, ed è nominato dal Rettore; dura in carica 4 anni ed è rieleggibile per non più di due mandati consecutivi.

Per il quadriennio 2003/04 - 2006/07 è stato eletto Direttore il prof. Agostino Fusconi, nominato con il Decreto Rettorale n.978 del 19 dicembre 2003.
Il 12 Settembre 2007 il Consiglio ha eletto Direttore del Dipartimento il prof. Domenico Bodega per il quadriennio 2007/2008 - 2010/2011, nominato con Decreto Rettorale n. 4546 del 8 ottobre 2007. A seguito delle dimissioni volontarie del prof. Bodega eletto Preside della Facoltà di Economia, il 4 Febbrio 2009 il Consiglio ha eletto Direttore del Dipartimento il prof. Lorenzo Caprio per il quadriennio 2008/2009 - 2011/2012 a cui è succeduto il prof. Marco Oriani.

Il Consiglio (art.32 Statuto)
Il Consiglio di Dipartimento è composto da tutti i professori di ruolo e dai ricercatori universitari afferenti al Dipartimento stesso, nonché, secondo quanto stabilito dal Regolamento Generale di Ateneo, da una rappresentanza dei professori a contratto (art.44, secondo comma), e da un rappresentante degli studenti iscritti ai corsi di dottorato di ricerca, ove questi siano gestiti con sede amministrativa presso l'Università Cattolica.
Il Consiglio programma le attività del Dipartimento e può eleggere al proprio interno una Giunta.

La Giunta
Marco Oriani (Direttore)
Mario Anolli
Massimo Belcredi
Donatella Depperu
Barbara Imperatori
Giovanni Petrella
Annalisa Tunisini

Commissione requisiti minimi
Eugenio Anessi Pessina
Barbara Imperatori
Lorenzo Caprio
Giovanni Petrella
Annalisa Tunisini

Amministrazione
Paola Magri

Commissione sito web
Rita Bissola
Rossella Gambetti
Giuliano Iannotta
Paola Magri
Federico Rajola