La funzionalità del Dipartimento si basa sui seguenti organi:

Il Direttore (art.31 Statuto): Prof. Mario Anolli (quadriennio accademico 2024/25 - 2027/28)
Il Direttore del Dipartimento è eletto dal rispettivo Consiglio tra i professori di prima fascia, secondo le modalità stabilite dal Regolamento Generale di Ateneo, ed è nominato dal Rettore; dura in carica 4 anni ed è rieleggibile per non più di due mandati consecutivi.

Per il quadriennio 2003/04 - 2006/07 è stato eletto Direttore il prof. Agostino Fusconi, nominato con il Decreto Rettorale n. 978 del 19 dicembre 2003.
Il 12 settembre 2007 il Consiglio ha eletto Direttore del Dipartimento il prof. Domenico Bodega per il quadriennio 2007/2008 - 2010/2011, nominato con Decreto Rettorale n. 4546 del 8 ottobre 2007. A seguito delle dimissioni volontarie del prof. Bodega eletto Preside della Facoltà di Economia, il 4 febbraio 2009 il Consiglio ha eletto Direttore del Dipartimento il prof. Lorenzo Caprio per il quadriennio 2008/2009 - 2011/2012.

Al prof. Lorenzo Caprio è succeduto il prof. Marco Oriani che ha ricoperto la carica di Direttore nei quadrienni 2012/2013-2015/2016; 2016/2017-2019/2020 (Decreto Rettorale n. 2833 del 16 settembre 2016) e 2020/21 e 2023/24 (Decreto Rettorale n. 6814 del 20 ottobre 2020).

Il 10 settembre 2024 il Consiglio ha eletto Direttore del Dipartimento il prof. Mario Anolli per il quadriennio accademico 2024/25 - 2027/28, nominato con Decreto Rettorale n. 299 del 12 settembre 2024.

Il Consiglio (art.32 Statuto)
Il Consiglio di Dipartimento è composto da tutti i professori di ruolo e dai ricercatori universitari afferenti al Dipartimento stesso, nonché, secondo quanto stabilito dal Regolamento Generale di Ateneo, da una rappresentanza dei professori a contratto (art.44, secondo comma), e da un rappresentante degli studenti iscritti ai corsi di dottorato di ricerca, ove questi siano gestiti con sede amministrativa presso l'Università Cattolica.
Il Consiglio programma le attività del Dipartimento e può eleggere al proprio interno una Giunta.

La Giunta
Mario Anolli (Direttore)
Massimo Belcredi
Ettore Croci
Donatella Depperu
Barbara Imperatori
Federica Poli
Annalisa Tunisini

Commissione requisiti minimi
Eugenio Anessi Pessina
Barbara Imperatori
Ettore Croci
Federica Poli
Annalisa Tunisini

Amministrazione
Paola Magri